Mungkin pernah ada yang mendengar tentang mikrobioma manusia. Ini adalah kumpulan mikroorganisme seperti bakteri dan jamur yang berbagi tempat dalam tubuh. Mereka termasuk mikrobioma kulit dan usus. Tapi seberapa banyak yang tahu tentang virome?
Virome adalah jumlah dari seluruh virus dalam tubuh yang ditemukan di setiap jaringan darah hingga otak. Bahkan terjalin ke dalam kode genetik di dalam sel. Virus adalah organisme yang paling banyak jumlahnya di bumi.
Meskipun diperkirakan memiliki jumlah sel bakteri yang kira-kira sama dengan sel manusia di tubuh kita (sekitar 37 triliun), mungkin kita memiliki setidaknya 10 kali lebih banyak partikel virus. Banyak dari virus ini terlibat dalam proses tubuh yang penting. Mereka membentuk bagian dari ekosistem tubuh. Mungkin dapat dikatakan, kita tidak bisa bertahan lama tanpa mereka.
Namun, kita masih memiliki jalan panjang sebelum mendekati untuk memahami yang dilakukan sebagian besar virus tersebut. Atau sebenarnya yang kebanyakan darinya. Diperkirakan, sejauh ini, bidang virologi baru hanya mengeksplorasi sekitar 1 persen dari keanekaragaman virus.
Sebagian besar virus masih belum ditemukan. Beberapa ilmuwan menyebut sebagai materi gelap virus. Meskipun demikian, mereka terjadi di seluruh bagian tubuh kita.Sebuah studi yang dipimpin Kei Sato dari Universitas Tokyo Juni 2020 menemukan, virus ada di jaringan manusia termasuk otak, darah, ginjal, dan hati.
Tim Sato ingin mengukur virus untuk membuat atlas virus dari jaringan manusia. Mereka melakukan dengan mereferensikan data urutan RNA terhadap perpustakaan genom virus. Tetapi ini berarti bahwa mereka hanya dapat menjelaskan segelintir virus terkenal yang sudah ada di perpustakaan tersebut.
Sato mengatakan, ini berarti sekarang ada bias untuk mencari virus yang diketahui kebanyakan berbahaya, yang dikenal sebagai patogen. "Selain bias dalam perpustakaan referensi genetik, sulit untuk mengumpulkan sampel di jaringan sehat di luar usus. Ini berarti kami mungkin kehilangan banyak virus yang tidak berbahaya atau bahkan berpotensi menguntungkan," terangnya.
Penyusup
Sangat mudah untuk menganggap virus sebagai penyusup asing yang berbahaya. Setelah melakukan kontak dengan permukaan sel manusia, virus menyuntikkan kode DNA atau RNA-nya, membajak mesin sel, secara efektif mengubahnya menjadi pabrik kapak untuk membuat virus baru.
Korona
Jika membayangkan virus sekarang, mungkin membayangkan cangkang proteinnya yang seperti pesawat luar angkasa. Ini disebut kapsid untuk mengangkut diri sendiri ke antar sel. Orang mungkin melihat virus korona yang bertanggung jawab atas pandemi Covid-19, SARS-CoV-2, dengan mahkota paku yang menutupi permukaan kapsid.Namun, virus tidak begitu asing seperti terlihat. Istilah virus sebenarnya menggambarkan entitas dengan atribut sangat beragam.
"Kadang-kadang kata-kata kita untuk hal-hal di dunia tidak benar-benar cukup," kata Frederic Bushman, ahli mikrobioma manusia dari Universitas Pennsylvania.Misalnya, virus dapat ditularkan melalui mekanisme yang sangat luas.
Untuk beberapa, yang disebut retrovirus endogen, DNA virus lewat langsung di antara sel manusia karena mereka terintegrasi ke dalam kromosom. Faktanya, 8 persen dari genom manusia terdiri dari retrovirus endogen ini.
Hanya sebagian kecil, kurang dari 2 persen,- kode DNA kita untuk produksi langsung molekul protein (dalam proses yang dikenal sebagai transkripsi), dan ahli biologi dulu menganggap sisanya tidak berfungsi - beberapa bahkan menyebutnya 'DNA sampah'.
Sekarang, banyak dari DNA ini diperkirakan berasal dari penyisipan virus sebelumnya. Ini telah ditemukan bahwa sangat penting untuk mengatur transkripsi gen lain. Beberapa gen virus memang ada di wilayah DNA manusia yang menghasilkan protein esensial. Selama sejarah evolusi, gen-gen tersebut telah dikooptasi untuk fungsi esensial tubuh kita. Maka, apakah kita harus menyebutnya sebagai gen manusia atau virus, tidak jelas.
SB/sciencefocus/G-1
